谜团一：为何人类居住在地球而不是金星上？
从表面上看，地球和金星(亦称启明星)在面积和质量上非常相似。两颗行星均拥有大约45亿年的"寿龄"，同时都有大气层。尽管金星绕太阳旋转的距离比太阳和地球之间的距离短4000万公里，但太阳抛洒在两颗行星的热量却相当。第一眼望去，金星看上去同地球一样，也适合生命存在。一种理论认为，数百万年前，金星表面有海洋。然而，金星上无法存在任何生命形式。由于强大的温室效应，金星表面温度目前高达500摄氏度左右，甚至比离太阳最近的行星水星还要热。
在拥有数百万年历史的金星上，是否存在高度发展的文明？金星文明或许是被某种全球灾难毁灭，而这种灾难即将降临到地球身上，即因为工业排放，大气层长期以来不断升高的温度很大程度上是太阳吸收大气层中某些气体造成的。这一进程是不可逆转的，因此，所有生命形式都将面临死亡厄运。"金星快车"应该可能帮助科学家找到金星受温室效应影响如此严重的原因。
谜团二：金星以错误方式绕其轴心旋转
同太阳系中其它行星相比，金星绕其轴心反方向旋转。从金星上远眺，太阳在西边升起，在东边落下。科学家原来认为，金星是唯一一颗以这种方式旋转的行星，直到他们在天王星上也发现同样的现象。但这两颗行星如此运转的原因尚不清楚。两条最基本的理论都同陨星撞击和两颗行星核心地区无法解释的进程有关。
谜团三：金星一天超过地球一年？
这一谜团取决于这样的事实：金星绕其轴心缓慢运行，与此同时，它绕太阳运行的速度却十分快。金星的一天相当于地球的244天。另一方面，金星绕太阳一周需要224.7天。一些理论仍坚持，金星上的一天在过去被认为相当短。但后来，不知出于什么原因，金星绕其轴心旋转的速度忽然慢了下来。也许，这个谜团的关键在于"金星快车"探测器靠近金星轨道时发现的其它现象。
谜团四：金星是实心还是空心？
"金星快车"拍摄的照片显示，金星南极上空似乎悬吊着一个巨大的黑色物体，看上去就像具有风卷残云之势的大气旋风，蜿蜒穿过漩涡，消失在金星表面地下深处。换言之，金星地表下可能有大洞，两极也有缺口。专家推荐那些寻求获得对这一现象更详细、更生动描述的爱好者阅读弗拉基米尔·奥布鲁切夫的《Plutonia》和在埃德加·爱伦·坡瓶子中发现的手稿。此外，旋风照片看上去同16世纪荷兰制图学家和地理学家戈哈杜斯·墨卡托所绘制的谜一般的图表相似。这些图表显示，四股洋流在北极附近汇集一起后，便迅速消失在无尽的深渊中。
谜团五：金星上有生命存在吗？
科学家们确信，金星上不可能存在任何生命形式，因为其表面平均温度通常高达500摄氏度左右，其压力是地球压力的90倍。然而，"金星快车"仍有可能在距离金星表面50千米高处的金星大气层中发现生命形式。那里的温度没有金星表面温度那么高，大约只有70摄氏度，压力也同地球压力相似。在如此高度的金星大气层中，甚至还有一些水汽。据莫斯科生物化学学院生物学博士亚历克谢·托普诺夫、德克萨斯大学的美国研究人员德克·舒尔兹-马库和路易斯·欧文说，上述环境是极有可能存在生命形式。
为了以某些合理的证据支持该理论，托普诺夫提到在地球海底火山口发现的微生物。在处理完由苏联两个探测器"维尼拉"和"维加"所收集到的数据后，美国科学家在金星大气层中发现了羰基硫化物。他们认为，无机物源很难产生上述气体，因此，它可以被看作是生物有机活动的间接信号。科学家对金星进行的研究还表明，金星大气层中的紫外线辐射事实上从5万米至7万米向下开始逐渐减弱，好像是金星被某种能吸收那部分光谱的屏障包起来一样。因此，科学家提出了金星高空大气层存在微生物的理论。科学家认为，与植物和草药在光合作用时利用阳光作为能量不同，金星大气层的微生物利用紫外线进行某些进程。
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