这起两岸海上冲突事件，双方说法不一。台湾海巡署的说法是，马祖海巡队5506艇周日（14 日）在东莒外海，发现大陆"闽长渔4108号"渔船非法越界捕鱼，台湾海巡人员进行拦检，4 名队员跳上大陆渔船，船上10多名大陆渔民强力反抗，台湾海巡队员曾对空鸣枪警告，但对方并不理会。
冲突中，台湾海巡人员寡不敌众，2名队员跳回海巡队船艇，小队长许志益及队员江少南则遭挟持往大陆方向前进。许志益于途中伺机跳海获救，江少南则被大陆渔民持刀械架住脖子，多艘赶到支持的台湾海巡署巡逻艇不敢贸然行动。
福建省台办发表的声明中，则指台湾海巡人员拦检时曾打伤2名大陆渔民，并对大陆渔船驾驶舱开枪，渔民为求自保，才留置江少南。
被带到福州的江少南，经台湾陆委会、海基会，及正在大陆的台湾立法委员曹原彰等人，与大陆方面沟通协调后，周一（15日）下午获释。台湾方面循两岸小三通路线，船只由马祖开到福建马尾，接回江少南。江少南所携配枪，大陆方面也予以交还。
这起事件，是两岸之间的渔事纠纷中，第三起台湾警方人员遭挟持到大陆案。1991年3月曾发生类似冲突，3名台湾保警被大陆渔船带到福建；1997年10月类似事件中，有1名台湾保警庄镇耀遭砍伤后被带到大陆。过去两次事件，发生地点与这次同样在马祖附近海域，而前两次台湾保警都被留置在大陆1到2个月才得以返台，这次则历时一天落幕。
不过，后续的责任归属问题，可能仍待两岸相关单位协商。台湾舆论也相当关切此类问题，呼吁政府妥善处理。
此外，就在马祖海域发生此海上冲突之际，台湾本岛的台中海巡人员这两天也查获多艘越界捕鱼的大陆渔船共31名渔民，在没收渔具后，将他们驱离。
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