以国民党中常委台北市长马英九为首的一派，支持党主席连战留任。马英九说，党主席应付的责任是根据败选原因，对党内问题进行彻底改造。
马英九今天（12月4日）告诉记者，连战接手的已经是一个分裂的政党，"让党员回家"才是连战应付的重大责任，这种负责方式比下台更有利于国民党的发展。
马英九还支持国民党与亲民党在立法院中结盟合作。
但同时，国民党内的另外一派反对与亲民党合作，他们认为，亲民党在选举中夺走了国民党的选票，并认为党主席连战应为大选惨败引咎辞职。
国民党立法委员徐中雄认为，国民党应该与亲民党划清界限，他说，国民党和亲民党将来在立法院中没有合作的可能。
十字路口
此外，国民党中部分立法委员表示，支持陈水扁提出的建立有广泛基础的联合政府的提议，但国民党领导层对此则持反对意见。
同时，本届选举国民党高层筹划人士和发言人已经辞职，承担对选举失败的责任。
目前日益加剧的观点分歧会不会导致党内的进一步分裂，国民党正处于一个关键的十字路口。
国民党在去年的总统大选中落败，失去了中央执政权，这次又在立法院选举中遭到惨败，所占席位从123席降到68席，失去了立法院中第一大党的地位。
但同时，任何其他政党也都未能在立法院中获得多数，总统陈水扁正在寻求结盟伙伴，共同对付台湾面临的最严重的经济萧条和创纪录的失业水平，并一同修补与中国大陆的关系。
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