据报导，赖昌星及其远华集团大肆从事走私活动，早在北京当局的掌握中。距远华案发前一年的第九届全国人大召开时，一福建省高级官员向刚当选总理的朱镕基介绍赖昌星及其远华集团对福建及国家的贡献如何之大，并请朱镕基接见赖昌星。朱镕基当即指赖昌星及远华集团存在严重的走私行为，“如果他愿意补交数十亿的税款，就可以考虑接见。”此后相当一段时期，中共并未对此走私立案，就是因为其中涉及中共高层的背景。
福建省前省委书记、目前任中共政治局委员、北京市委书记的贾庆林，中共军方及公安部的相当一部份高级官员都是其政治后台，而贾是江泽民一手提拔的亲信红人，所以不能轻易动得。北京政界人士透露，远华案之所以案发其实是源于中共高层的政治斗争。去春，朱镕基访美时，为加快中国市场经济的建设步伐，在与美国签署经贸协定中作了相当让步，让步程度甚至超出美方预期甚多，引起国内各产业部门的不满，朱甚至被人骂为“李鸿章第二”，以李鹏为首的反对派乘机向朱镕基发难，江泽民也因朱张扬的个性和超高民意支持而感到不满和受威胁，因而朱访美回国后的处境非常被动。
更严重的是，不久后发生中国驻南联使馆被炸事件，无异让朱的处境雪上加霜，关键时期朱被迫提出辞职，但为防止因深得民意的朱辞职可能引爆内乱，江泽民断然拒绝朱的辞职，但准备在事件平息后以自己的亲信贾庆林顶替朱镕基任总理。然而尽管朱镕基一再表明自己不是政治家不会耍权术，但也决非是个省油的灯。他抓住贾庆林的远华背景，联合乔派（乔石）人物尉建行开始全面调查远华走私案，从而彻底击碎江泽民想让贾庆林顶替朱的计划。
为了避免贾庆林落马，有损自身形象和地位，江泽民一度带着贾庆林在国内四处视察，让贾频频露面，为其“辟谣”；江此一举措，引起朱的不满，江则藉接班之需，让胡锦涛行使部份总理权，以架空朱镕基。迄今，远华案处理已近两年，被审和即将被审的中共官员共两百余人。北京消息人士说，只要朱镕基不被撤职或不出其他意外，朱一定会在其任内以审赖昌星为突破口，进一步深究中共高层的腐败，兑现其刚出任总理时对民众的承诺。
然而，如果朱真采此举措，则必然引起中共高层的激烈冲突。因为江不想在中共十六大上全退，也就不会容许有损自己形象的事情发生，朱如继续深究，江必失信于天下，也就为第四代中共领导集体阻止江继续把持军权提供了理由。北京观察家认为，远华走私案最终的处理结果会是多杀几个位重权虚的高官，赖昌星也是必死无疑，一切都以不损害中共及江泽民地位为目标。（工商时报2000/12/06）
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