台湾在野的民进党立委管碧玲日前在立法院质询时指出，目前台湾仍然不承认中国的学历，以及大学的学分，不过，台湾的淡江大学和东海大学却违反了相关的规定。
管碧玲指出，这两所学校在中国都有几十位的交换学生，淡江大学的做法是，只要系所主管同意，就可以承认大陆学分，至于东海大学方面，学生虽然在大陆学习，可是，成绩却是由东海的老师来打分数。
对此，台湾教育部长吴清基回应指出，台湾欢迎两岸学术交流，但是，在还没有承认大陆学历的情况下，如果有大学违法，一定会处分，此外，台湾学生在大陆获得的学分，也不会被承认。
教育部还指出，这些学生，如果因为学分不被承认，而必须推迟毕业的话，学校要自行善后，此外，教育部也将扣减这两所学校的补助款，做为惩处。
虽然符合潮流，仍然是违反规定
台湾执政的国民党立委赖仕葆认为，这两所学校的做法，虽然符合潮流，不过，现阶段来看，仍然是违反规定。
他说："特别是东海和淡江大学一定有点纳闷，马政府现在在积极推动两岸学历的承认，他们的做法等于是符合台湾现在的主流，主流就是往这个方向在走，但是，由于相关的办法还没有出来，按规定，还没有就绪之前，我想，依规定，他们是违规的。
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学校不应该揣摩上意
在野的民进党立委翁金珠认为，台湾的学制有一定的规定，任何学校都应该配合与遵守。
她说："学校不应该揣摩上意，认为中央现在什么都倾向中国，什么都可以，然后就一味自作主张的这样做，我觉得这样是不应该的。"
淡江大学发表声明指出，该校大陆研究所以及会计系、国贸系、经济系学生是到大陆大学移地教学2周到2个月，学生回台之后要交报告，然后由淡江大学任课老师打学期成绩，一切合乎规定。
东海大学则有中文系、历史系、政治系等系的学生到大陆复旦大学、厦门大学、吉林大学、南京大学、北京语言大学、中山大学、四川大学等八所学校，学习和台湾原系相对应的课程一个学期。
全面检讨，进行修正
这些学生回台之后，再由东海老师口试或笔试给予成绩，也就是，学生人在大陆上课，但是，学期成绩则是由东海老师来打。
东海大学表示，该校学生到大陆和世界其他国家进行交换，做法是一样的，并没有要违反教育部的规定，不过，该校会虚心接受指导，全面检讨作业办法，并进行修正。
