在浩瀚的二十四史中，能夠被立傳的醫生並不多，扁鵲就是這為數不多的名醫之一。司馬遷在《史記》中有《扁鵲列傳》，宣揚了這位神醫的功績。扁鵲的一生，留下了許多傳奇故事，如為虢國太子治病，望齊候氣色知病深淺，在有些歷史記載和民間傳說中，扁鵲堪稱神醫，無論什麼疑難雜症他都能手到病除，最為神奇的就是說他能夠透視人的五臟六腑，具有特異功能。
按照《史記》的記載，扁鵲姓秦，名越人，是渤海郡鄚人。鄚在戰國時屬趙國，漢置縣，到了唐代改為莫，故城在今河北省任丘市鄚州鎮。秦越人年輕時虛心好學，刻苦鑽研醫術。他把積累的醫療經驗，用於平民百姓，周遊列國，到各地行醫，為民解除痛苦。由於秦越人醫道高明，為百姓治好了許多疾病。他在趙國行醫時，趙國人民送他「扁鵲」稱號。扁鵲是一個「胸以上是人，胸以下是鳥」的神物，這是以鳥為圖騰的趙國人把能夠使他們逢凶化吉、轉危為安的扁鵲視作福佑他們的神靈，因而，「鳥人合一」就成了趙人的圖騰崇拜對象，扁鵲也就被神化為一個「人面鳥喙」的神物。另外傳說黃帝時代有一個神醫叫扁鵲，日本學者滕惟寅說：「扁鵲，上古神醫也。周秦間凡稱良醫皆為之扁鵲，猶釋氏呼良醫為耆婆也，其人非一人也。」他把「扁鵲」作為神醫的名號，只要是公認的神醫都可以稱之為扁鵲。
司馬遷所說的「扁鵲」叫秦越人，少年時代曾在一家旅館作領班，有一位在這家旅館經常住宿的客人叫長桑君，非常喜歡這個年輕人，就把自己的醫術傳給了秦越人。秦越人行醫以後治好了很多疑難大病，遠近聞名，他的行醫事跡及醫學成就，可以反映出先秦時期的醫藥水平和醫藥特點，所以先秦有不少著作載有他的事跡。扁鵲看病行醫提出了「六不治」原則：一是依仗權勢，驕橫跋扈的人不治；二是貪圖錢財，不顧性命的人不治；三是暴飲暴食，飲食無常的人不治；四是病深不早求醫的不治；五是身體虛弱不能服藥的不治；六是相信巫術不相信醫道的不治。反映出扁鵲的個性與特色。後來因為給秦武王治病，遭到秦王太醫李醯的妒忌，最終派人殺死了扁鵲。以致司馬遷感慨地說：「女無美惡，居宮見妒；士無賢不肖，入朝見疑。故扁鵲以其伎見殃，……故老子曰‘美好者不祥之器’，豈謂扁鵲等邪？」
相傳中醫經典著作《黃帝八十一難經》是秦越人所作，這本書以問答形式，共討論了八十一個醫學上的問題，故又稱《八十一難》。其中一至二十一難講脈學，二十二至二十九難講經絡，三十至四十七難講臟腑，四十八至六十一難講疾病，六十二至六十八難講腧穴，六十九至八十一難講針法。所以《難經》也是學習中醫必讀的經典之一，東漢名醫張仲景在寫《傷寒雜病論》時，就將《八十一難》作為重要參考書。但是經專家考證，《八十一難經》是在《黃帝內經》之後問世的作品，其著作年代應該是在漢代，不大可能是秦越人本人所寫。也有人認為，《史記》說：「至今天下言脈者，由扁鵲也。」說明扁鵲的學術可以自成學派，而且傳承很廣。扁鵲有很多學生，如子陽、子豹等，醫術都很高明，《難經》也可能是扁鵲弟子們整理的「扁鵲學派」著作，是對扁鵲學術的傳承。
