臺灣高屏溪流域淤積嚴重，河道上的砂土幾乎已和路面一般高，高雄縣長楊秋興指出，若以目前全臺每年清淤量約五百萬立方公尺計算，至少要五十六年才能清完。
莫拉克颱風過後河川淤積嚴重，以目前全臺年清淤量約五百萬立方公尺計算，光是高屏溪流域的淤沙就要花五十六年才能清運完成。臺南縣長蘇煥智、高雄縣長楊秋興及屏東縣長曹啟鴻昨天出席全國治水會議時，都呼籲加速疏濬，否則明年汛期一到，水患還是會重演。
楊秋興指出，高屏溪流域旗山溪、荖濃溪、濁口溪及其支流河道嚴重淤積，重淤積面積約達三十萬公頃，若淤積高度為五十公分，則有約一．五億立方公尺的土方，若淤積高度為一公尺，則土方更多達近三億立方公尺，以目前每年清淤量約五百萬立方公尺計算，至少要五十六年才能清運完成。
治水會議召開 地方疾呼加速疏濬
蘇煥智也說，南縣就有八掌溪、急水溪、曾文溪、鹽水溪、二仁溪等五條中央管轄的河川淤積嚴重，中央管轄河川疏濬進度亟需加速。
清淤速度慢，楊秋興分析說，現行的砂石採售分離制度，造成清淤慢，運出量遠小於淤積量，導致河床淤積嚴重。
蘇煥智提到，目前包括山坡地、林班地、水庫、河川、區排到出海口沙洲，分別由不同機關管理，建議成立流域管理局，以河川流域為單位，作有系統的治理，其中曾文溪應優先成立流域管理局。
曹啟鴻表示，此次莫拉克颱風造成嚴重水患，與河爭地是主因，應該要將河道還給河川，如中游地區的台糖土地，可作為疏洪區；該遷村就遷村，讓河道可以加寬，回覆原有的調節功能；至於下游的堤防也要加高、加固。
成功大學副校長黃煌煇認為，流域整體治理是目前因應氣候變遷的最佳之道，應該要建立流域治理管理委員會，且位階要高於現在的各相關單位。
水利署長陳伸賢在總結時建議行政院指定部會下設"國家氣候變遷調適辦公室"，擬定氣候變遷調適政策綱領及整合機制，處理跨部會協調及整合事務。
此外，陳伸賢說，"行政院組織法"修正草案正由立法院審議中，評估整合流域管理及水資源事權，成立以治水及水資源為核心職能的專責部會，其下設置重要流域管理專責機關。他另主張推動水價合理化，並制定新興水源發展條例，積極發展海水淡化、水再生利用等新興水源。
對於淤沙問題，陳伸賢表示將盡速研議土石採售機制，在明年六月底前，優先完成有保護標的的急要河段疏濬兩千五百萬立方公尺。
