嫌疑指向「基地」組織
巴厘島爆炸案是「9．11」事件後世界上發生的最大恐怖事件。連日來，警方主要從現場人員和彈藥來源追查線索，目前已查問了52名現場證人，其中包括10名當時在場的巴基斯坦人。目前警方表示已掌握一些有關凶手的資料，併發現了炸彈中的C4軍用塑膠炸藥成分，偵查取得初步進展。
目前，大多數西方分析家認為，巴厘島爆炸案具有「基地」組織的作案特點，只有「伊斯蘭祈禱團」有意圖和能力搞這樣的專業恐怖案。但也有反恐專家認為，犯案者可能是印尼軍人或東帝汶的親印尼民兵，因為從炸彈的威力來看，惟一能提供這類炸彈的顯然是軍隊。與此同時，「伊斯蘭祈禱團」精神領袖阿布巴卡爾也針鋒相對地表示，印尼激進組織未涉及襲擊，他甚至還說這是美國在幕後策動的襲擊。
14日，美國駐印尼大使博伊斯稱，最近蒐集到的證據證實「基地」組織的確在印尼活動，而且還同當地極端分子相勾結。他表示，印尼有多個小規模的極端組織有製造大災難的潛力。
凶手精心選擇巴厘島
除了凶手之外，人們最關心的問題是：爆炸為什麼會發生在巴厘島。巴厘島憑藉其美麗的風光、良好的治安，一直是印尼旅遊創收的經濟命脈。印尼有分析家指出，爆炸事件應不會僅是「基地」組織所為，內外勾結的可能性較大。
雖然巴厘爆炸案中受害的大多是外國人，但也重創了印尼經濟和國際形象，擊中了現政府的要害。若僅是外來「基地」組織人員作案，應考慮印尼的穆斯林國家背景。其次，選擇巴厘島符合恐怖襲擊的規律，其目的是針對西方人士。
印尼警察在爆炸現場檢查
據悉，發生爆炸的酒吧只對外國人開放，爆炸發生時是顧客光顧的高峰時間，凶手作案前顯然是經過了周密的策劃。另外，印尼島嶼眾多，海岸線長，軍方無力全線防備。「9．11」事件後，恐怖組織已經很難對主要的大目標下手了，巴厘島一直相對安全，保安不太嚴密，選擇此地較容易下手。
恐怖份子頻頻下戰書
最近一個多月，國際上連續發生恐怖事件。9月初，阿富汗總統卡爾扎伊險遭暗殺，美國也在距離白宮約5公里的地方逮捕了一名預謀刺殺布希的嫌疑犯，針對政要的暗殺陰謀正在增多。最近，駐科威特的美軍連續遭到當地伊斯蘭激進份子襲擊，美國駐外使館也頻頻遭到威脅。15日，美國駐法國使館就受到炸彈虛驚。此外，爆炸事件更是層出不窮，最引人注目的是法國油輪「林堡」號被炸和印尼巴厘島恐怖爆炸案。這些恐怖活動適逢美國「9．11」事件週年和美國「科爾」號驅逐艦挨炸兩週年期間，西方情報機構大多認為，這些事件與「基地」組織有著直接或間接的聯繫。《紐約時報》近日在頭版刊載特稿指出，「基地」組織已經開始發動新一輪的陰謀活動，而且很可能是規模更大的襲擊。
美國和亞洲一些國家的情報機關均認為，最近的爆炸事件都帶有恐怖組織行動的主要特徵，符合「基地」組織的作案手法，這些事件應與在該地區活動的「基地」組織有關。
從印尼爆炸案看，在幾乎同一時間製造多起爆炸事件，正是「基地」組織訓練手冊中強調的戰術；恐怖份子的作案時間也是經過精心選擇的。此外，襲擊對象為高價值的經濟目標，也是「基地」組織近來的重點攻擊方向。最近，拉登助手扎瓦希里在錄音帶中威脅要繼續攻擊「美國及其盟邦」，並譴責美國準備攻打伊拉克的行動。卡達「半島」電視臺也播出了拉登的錄音帶。美國官員相信，這兩盤錄音帶是「基地」組織在為新一輪恐怖襲擊尋找理由，也可能是發動大規模恐怖襲擊的戰書。
從「基地」組織及其支持者的新一輪恐怖活動來看，其主要矛頭仍指向美國，當然還包括西方和其他地區支持美國反恐戰爭的國家。由於美國對恐怖襲擊的防範措施越來越嚴，恐怖份子在不能直接襲擊美國目標的情況下開始將襲擊目標擴大到西方其他國家。據英國《泰晤士報》10月11日報導，月初襲擊法國油輪「林堡」號的是一個名為「亞丁伊斯蘭軍」的激進組織，該組織與「基地」組織有聯繫，而他們原定的爆炸目標是停泊在代巴赫港的美國海軍護衛艦。
但由於無法接近該護衛艦，於是他們改變目標，用一艘裝滿炸藥的舢板襲擊了法國油輪。近日，英國警方發布調查報告稱，恐怖份子正在策劃襲擊英國輪船和皇家海軍的軍艦。
恐怖源頭在蔓延
目前，「基地」組織在世界各地呈網點狀分布，在菲律賓、印尼、孟加拉國、中東，甚至美歐等國家和地區都潛伏有成員。「基地」組織在其他國家的秘密網點很多，外界估計數目從20到60多個不等，其中許多並未被偵破，落網者也不多。此外，也有報導說，拉登已指定兩名接班人以備不測，並且已讓一名副手到還未引起美歐注意的孟加拉國躲藏。今年8月，在阿富汗繳獲的幾盤錄像帶顯示，早在4年前「基地」組織就著手培養大批恐怖份子並讓他們到世界各地潛伏，隨時準備發動襲擊。由此可以推斷，拉登可能在「9．11」事件前就留了一手。恐怖主義的源頭正呈蔓延趨勢。
「9．11」事件後，西方國家防範恐怖襲擊的措施普遍比較仔細，而支持美國反恐的東南亞和中東地區則稍顯薄弱，「基地」組織於是選擇在印尼、葉門等有相當「群眾基礎」而又有美國和西方國家利益的地方動手。據美國情報部門估計，去年9月之前，至少有幾百名印尼和菲律賓的穆斯林在阿富汗接受過「基地」組織訓練。去年12月，新加坡破獲了一起有「伊斯蘭祈禱團」成員參加的未遂恐怖案，逮捕的15名人員中有13人曾在阿富汗接受過「基地」組織的訓練。他們的矛頭所指也是美國人，計畫在該國東北海岸襲擊美海軍艦艇及其他美駐新機構。
「軟目標」成為攻擊對象
今後一段時間，城市「聖戰」有可能成為「基地」組織新的恐怖活動方式。
觀看過「基地」組織錄像帶的恐怖主義問題專家稱，拉登訓練營對其學員進行了嚴格的城市作戰技巧培訓，以便讓他們在西方國家的城市中發動「聖戰」。
他們組織學員練習使用炸藥摧毀房屋、辦公樓和橋樑，還練習如何使用地空導彈，接受這些特種訓練的學員也是「精英中的精英」。恐怖份子這種高強度訓練和多種多樣的戰術對西方國家已經構成現實和迫在眉睫的威脅。美國國務院的研究報告稱，恐怖份子的興趣已經轉移到夜總會、餐館、教堂、學校等象徵西方文化、宗教力量的地方，這些「軟目標」正在成為恐怖份子的攻擊對象。
此外，「基地」組織活動的頻率估計還會加大，因為他們的恐怖資金鏈並未被完全斬斷。8月末，聯合國的一份報告就明確指出，「基地」組織在阿富汗邊境地區，尤其是巴基斯坦一帶依然非常活躍，而且通過中亞、土耳其及巴爾幹半島的移民網路，迅速滲入西方世界。他們更在西歐及美國致力於籠絡有正式居留權的人士，利用這些人不需簽證即可四處遊走的優勢，進行組織活動。
該報告也指責國際金融機構對於管制「基地」組織資金流動以及凍結其資產很不積極，難以對以合法名義進行慈善活動的伊斯蘭非政府組織的資金流動進行有效監督，武器依然可順利流向「基地」的下游團體，使恐怖活動防不勝防。
