杨尚昆对六四事件的保留态度，早有流传，率先对外媒揭露北京瞒报非典病例的解放军301医院前院长蒋彦永，2004年给中央写信中披露杨在与他两人谈话时的明确表态，最引起震动。而在杜导正《赵紫阳还说过什么？》一书中，更得到了印证：
邓南巡讲话及6月两次去首钢（首都钢铁公司）讲话，都说明邓对江泽民（时任中共中央书记）、李鹏体制很为不满。给人印象：要解决江、李。江、李那个时期， 惶惶不可终日，许多工作也停下不做了。此时，杨尚昆、万里误以为邓（小平）换江（泽民）、李（鹏）的决心下了，便做出以杨（尚昆）为首组成中共中央顾问小 组决定，以代替邓过世后做“最高权威”。万里也在政治局会议上当众说，“邓小平说，基本路线一百年不变。便是说有人要变！”
“十四大”前，邓权衡了利弊诸多因素后，看来最后下决心是，主张的倾向性有了变化。邓先倾向于撤换江（泽民）、李（鹏），后改为江（泽民）、李（鹏）不动。
邓此时看来主要考虑以下两个大问题。不仅此时，恐有长时间了。第一个问题，他身后，中国改革开放事业能否坚持下去？即能否继续下去？否则，他主张的改革开 放错了，会有人起来批判他，将他定为罪人；第二个问题，他身后会提出“六四”问题，邓究竟错了？对了？负什么责任。这两个问题中，看来，邓想得多的是第二 个问题。因为改革开放，说世界大潮，中国绝大部分人支持这个主张，别人反邓，很困难。这 “六四”非同小可。如你所说的中国干部、知识分子对这个问题绝不会淡忘。这个问题太大了。邓内心是知道这个问题的份量的。在“六四”问题上，李鹏不用说 了，江，在上海也是有账的，《世界经济导报》事件便是江搞定。邓以为，维持江、李体制，“六四”问题在邓身后，大家不能提出。既然做了这种估计，尚昆自然 失算了。尚昆与江分歧由来已久，此次当然尚昆要下台了。当然，尚昆如是在过去与江关系好些，对江尊重些，尚昆此次不至于处境如此悲惨。
我说：“《解放军报》一、二、三、四把手因将江泽民给美国记者谈话内容稿登四版，此种事已三、四次了，前几日被军委下令全部免职。”说到此处，赵说：“尚 昆自以为得到军内外老同志尊重，但老同志如张爱萍、萧克、杨勇……全反对他！”(杜导正《赵紫阳还说过什么？》P48)
1995年6月16日，杨尚昆、杨白冰在山东视察工作与村民合影。
杨尚昆失算，张爱萍、萧克、杨勇全反他
杨尚昆对六四不坚决，邓产生了疑心
中午过后不久，杜瑞芝同志来坐。他说，10月14日上午我去看望了赵（紫阳同志）。我静静地听他讲，偶然插几句话。
杜说：“杨氏兄弟突然失宠，简直一抹到底，近因是在邓处，杨尚昆说：‘我下，杨白冰上，进入政治局常委。’此话引起大家与邓的反感。远因是对‘六四’，杨尚昆不够坚决，邓有怀疑，对杨产生了疑心。”
杜说：“赵说，邓是绝对专权的思路，邓认为在中国这样的国家，如无个人专权、独断，无一政党专权独断，天下便要大乱，什么事情干不成！邓常说，只能一个婆婆，不能有两个婆婆。邓在这点上是非常明确、非常坚决的，绝不含糊的。”
