台湾台东县关山镇一处养猪场爆发国内猪只感染H1N1新流感首例，研判系畜主曾到中国旅游遭到感染，将病毒传给猪只；台湾农委会强调，吃猪肉不会感染猪流感，只要煮熟即可。
学者建议全扑杀 防检局称已管制
台湾农委会防检局长许天来表示，这家养猪场饲养三千四百头猪，台东县家畜疾病防治所于十月廿七日接获畜主通报，有一百六十头五周龄小猪出现咳嗽、流鼻涕、下痢等症状，经给予三头猪安乐死进行解剖并采样送验，证实有H1N1病毒。生病猪只出现三到七天的感冒症状后，已逐步恢复健康，病猪仅剩"个位数"。有学者建议，为避免相互传染造成病毒变异，病猪应全部扑杀，许天来强调，发病的猪场已做移动管制，等猪的病好了，一样可以上市贩售，不必扑杀。
家卫所长黄金城表示，根据疫情调查，畜主曾到中国旅游，回来一段时间后觉得身体不适，但症状不明显，猪流感爆发可能与此有关。但是许天来对于"畜主何时到中国？何时发病？以及猪何时发病？何时通报？"等细节，都以"涉及个人隐私"回避不答。
台东家畜所表示，畜主是在十月十日国庆日前从中国返台，根据畜主回忆，猪只是在十月十九日发病。防检局的专家会议因而认为，传染原因疑为畜主到中国旅游后遭到感染。
但台东县卫生局长吕乔洋表示，畜主的中国旅游史与猪只新流感时间差太远，且畜主及亲友也无新流感病史。卫生署疾管局副局长林顶表示，养猪场相关的七名工作人员，其中一人两天前也出现感冒症状，但诊断为普通流感，快筛为阴性。
专家建议，应优先对猪农施打新型流感疫苗，不过疾管局官员认为，与猪只感染新型流感密切接触人员，其感染的风险并不高于其他族群，因此施打顺序不变。
多位专家都担心，如果猪只感染的是与人类同型的新型流感，猪只就会再传染给人类；如果是猪只之间的流感，不排除日后病毒在猪只体内突变重组后再传给人类。
台湾疾管局局长郭旭崧表示，H1N1新型流感病毒是人畜共通的传染病，"台东猪只身上的病毒采检结果，经过基因序列比对，发现与人的H1N1相似度高达九十七．五％，另有二．五％的差异。"黄金城解释，两种病毒可能有一点变异，但经过树状比对，跟人的新流感几乎是一致的。
郭旭崧说，H1N1病毒很脆弱，猪肉只要煮熟即可食用，不会有安全疑虑；至于腌肉则要看有没有腌透，所以无法保证没事，建议最好还是煮熟吃。许天来亦强调，目前国外没有猪传人的证据与案例，病毒也没有变异。
