台湾总统府以重建宪政惯例为由退回了行政院上周提出的总辞案，行政院长张俊雄预计将留任至5月20日新任总统就职为止，其内阁成员也可望获得留任。
按台湾过去的惯例在立法院改选后，应向立法院负责的行政院应该总辞；这是因为过去由总统提名的行政院长，形式上要通过立法院的同意。
但总统陈水扁在其批文上指出，台湾在1997年修宪后行政院长已不须立法院同意，其任期与立委选举无关，因此就宪法义务上，不需在新的立法院集会前总辞。
就政治现实面上来说，总统府认为2005年修宪后使立法委员任期延长，与总统一样都是四年，但新立法院与新总统就职日仅差3个月又19天，其间若行政院总辞两次，将影响政务推动与政局安定。
刚取得立法院多数席位的国民党立院党团虽不反对行政院成员留任，但以其留任的程序问题批评总统陈水扁藐视国会。
国民党党团书记长郭素春说，陈水扁应该先接受行政院总辞，再予以留任。
看守内阁
国民党的立法院长王金平则表示，若新总统就职前这几个月提出新内阁，并向立法院提施政方针，会让人没有确定感与案全感，应该把这段期间内阁视为总统选举前的看守内阁。
他并提出建议，在新总统就职前的几个月内，行政院不宜提出重大政策。
不过行政院新闻局长谢志伟说，从3月22日新总统产生至其5月20日就职期间的内阁，才是所谓看守内阁，在总统选举前民进党政府正常运作，没有看守内阁的问题。
包括谢志伟在内一些此前个别请辞的内阁成员，在行政院表示内阁整体将"同进同出"的情况下，预计也将留任。
内阁中部份成员发生出缺情况，据此间媒体转述不具名行政院人士的话说，这些职缺可能由一些落选的民进党立委出任。
台湾政府在立法院改选后原有意推派企业总裁CEO，出任这段期间的行政院长，但在国民党不表支持下，此项人事计划因而无法进行。
