蔡元培赴德國萊比錫遊學時，聽朋友李石曾談到食肉的害處，正好他又看過俄國大文豪列夫·托爾斯泰著作中關於打獵的慘狀描寫，蔡元培於是宣布不再食肉，還勸告朋友壽孝天說："蔬食有三義：一衛生，二戒殺，三節用。"並表明自己蔬食專是因為戒殺。
壽孝天回信引用杜亞泉的話說："植物未嘗無生命，戒殺義不能成立。"
對此，蔡元培說："戒殺者，非倫理學問題，而是感情問題。"
他解釋說，蔬食者不是絕對不殺動物，一葉一水中也有不知道多少動物，但因為常人無法看見，所以感情也未能顧及。而對於能夠看見的動物，感情則可以顧及，所以要戒殺。
拒絕坐轎
蔡元培一生對坐轎最為反感，他認為用人抬人，是不人道的事；而且兩人甚至三、四人為一個人代步，也不經濟。
而人力車伕一個人拉一個人，經濟倒是經濟，但眼睜睜地看到人家佝僂喘氣出汗，實在大為不忍。所以他有船則坐船，有公車則坐公車。他認為腳踏車和摩托車最為文明，不得已時坐馬車。實在沒有辦法要坐人力車時，他首先問好價錢，一到即付錢，絕對不討價還價。
其責也嚴
很多北大的教師、學生對於蔡元培的印象都是從不隨便誇獎人，也不嚴厲責備人。但是，據其學生、後來還做過北大代理校長、臺灣大學校長的傅斯年回憶，蔡先生有時候責人也是十分嚴格的。
當時傅斯年的班上有一個同學，因為長成一副官僚面孔，做事也很不討人喜歡，於是有人貼出了"討伐"告示，對該同學加以諷刺挖苦，結果引來更多的匿名帖子，一起攻擊該同學。當時，大家都很得意，以為痛快淋漓。
沒想到蔡元培在一次大會上嚴詞批評，指出大家對同學的不滿可以進行規勸，才是同學之誼，如果不可規勸也該對校方反映。
現在用揭帖的方式，受之者即使有過錯，也絕不會改悔了；而對揭帖的人自己，則已是喪失品性的開端。
這次訓話後，北大的匿名壁報基本上絕跡了。
還有一次，北伐取得勝利，很多學生在蔡元培家裡吃飯，大家興高采烈，喝了不少酒，蔡先生自己也喝多了。
年輕才子傅斯年藉著酒勁說起狂話來了，他說以後我們國家強大了，不但要消滅日本小鬼，就是西洋鬼子也要趕出蘇伊士運河以西，天下統統"郡縣之"。
沒想到蔡元培怫然變色，聲色俱厲地說："這除非你做大將！"
即使是酒後，蔡元培也絕對不能允許學生有"己所不欲施於他人"的狂妄之語。傅斯年先生此後每想起此事，就感到羞愧不已。
