皇帝死後一般都有陵墓，唯獨元朝皇帝沒有留下一座陵墓。這是一個千古之謎。
明朝葉子奇《草木子》中記載：元朝皇帝駕崩，" 用囉木兩片，鑿空其中，類人形大小合為棺，置遺體其中......加髹漆，畢，則以黃金為圈，三圈定(箍兩頭、中間)"。然後，掘深溝一道埋葬，"以萬馬蹂之使平。殺駱駝於其上，以千騎守之。來歲草既生，則移帳散去，彌望平衍，人莫知也"。
當年成吉思汗去世，就是採用了這種方式下葬。據記載，成吉思汗在寧夏病逝後，其遺體被運往漠北肯特山下某處，在地表挖深坑密葬。其遺體存放在一個將大樹中間掏空做成的獨木棺裡。獨木棺下葬後，土回填，然後"萬馬踏平"。為了不讓外人看出曾經動土的痕跡，還要用帳篷將周圍地區全部圍起來，待到墓葬地面上的青草長出，與周圍的青草無異，才將帳篷撤走，這樣墓葬的地點就不會泄露了。
全套工作完成後，蒙古人在墓葬地表殺死一頭小駱駝，這時，陪伴這頭小駱駝前來的母駱駝就會十分悲痛地號叫，並且記住這個地點。第二年來祭祀的時候，把這頭母駱駝牽來，在殺死小駱駝的地點，母駱駝就會悲痛地流淚。這樣，前來祭祀的人就能找到墓葬的確切地點。
元朝建立以前，蒙古人有自己獨特的喪葬習俗，其特點是薄葬簡喪。蒙古人是生活在草原上的遊牧民族，他們沒有固定的居所，生活方式比較簡單實用。特別是在蒙古人大舉擴張的戰爭年代，喪葬儀式尤其簡單。下葬時，他們讓死者坐在一頂生前用的帳幕中央，邊上圍著祭祀的人進行禱告，隨葬的有馬匹、弓箭和擺放著肉乳的桌子，最後放入土中。目的是死者到另一個世界上生活時，有帳幕住，有馬騎，有肉乳吃。
忽必烈建立元朝以後，實行漢法，也漸漸受到漢人喪葬習俗的熏染，開始用棺木入葬，但所用棺木與漢人不同。死者入殮後，兩塊棺木合在一起，又成為一棵圓木，然後"以鐵條釘合之"。儘管入主中原，蒙古人入殮仍然儉樸如初，壽衣大多就是平時穿的衣服，隨葬的器物也會比較少，大部分是死者生前喜好的武器，如弓箭、刀劍一類的東西。
元朝皇帝死後和一般的皇族及貴族稍有不同，皇帝死後首先是要有一個下葬的儀式，隨葬品也要多一些，只是在皇帝下葬時不得有漢族官員參加，也不會在地面上建設大規模的建築物，不設功德牌坊和墓碑，一切看起來都很簡單。另外為了不留下可以讓盜墓賊發現的線索和痕跡，對下葬地點的記載也少得可憐，以至於讓人感到元朝不存在皇帝陵墓。
記錄的不完整和有意地編造，使後代很難瞭解這方面的真相。這或許就是元朝皇帝沒有陵墓的緣由。但不是沒有，而是沒有發現。
